サイエントロジー教会の階層内には、大陸連絡局(Continental Liaison Office = 略称CLO)のネットワークがあります。CLOは世界の特定の区域においてサイエントロジーの活動を調整する役割を担当する、教会の地域事務局です。CLOはそれぞれの担当区域にある地方教会やミッション、グループの活動を援助し、またそれらの地方教会が携わるすべてのサイエントロジーの活動を調整し、結集させる役割を果たします。また、それらの組織とグループが健全な状態であるかについても気を配っています。このようにして、教会、ミッション、フィールド・オーディターと他の関連グループの活動は統合されています。それにより、最終的にはその大陸地域にいるすべてのサイエントロジストの精神的な進歩という結果がもたらされるのです。
教会組織の管理を行う大陸連絡局は、次のような場所に設置されています。カナダ地域:トロント。欧州地域:コペンハーゲン。アメリカ合衆国東部地域:ニューヨーク。アメリカ合衆国西部地域:ロサンゼルス。オーストラリア、ニュージーランド、アジア・オセアニア地域:シドニー。中南米地域:メキシコシティー。アフリカ地域:ヨハネスブルク。英国および連合王国地域:イギリス・サセックス州セントヒル荘。